<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.1//EN"
"http://www.w3.org/TR/xhtml11/DTD/xhtml11.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head><meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8" />
<title>[141843] trunk/dports/science/berkeleygw/Portfile</title>
</head>
<body>

<style type="text/css"><!--
#msg dl.meta { border: 1px #006 solid; background: #369; padding: 6px; color: #fff; }
#msg dl.meta dt { float: left; width: 6em; font-weight: bold; }
#msg dt:after { content:':';}
#msg dl, #msg dt, #msg ul, #msg li, #header, #footer, #logmsg { font-family: verdana,arial,helvetica,sans-serif; font-size: 10pt;  }
#msg dl a { font-weight: bold}
#msg dl a:link    { color:#fc3; }
#msg dl a:active  { color:#ff0; }
#msg dl a:visited { color:#cc6; }
h3 { font-family: verdana,arial,helvetica,sans-serif; font-size: 10pt; font-weight: bold; }
#msg pre { overflow: auto; background: #ffc; border: 1px #fa0 solid; padding: 6px; }
#logmsg { background: #ffc; border: 1px #fa0 solid; padding: 1em 1em 0 1em; }
#logmsg p, #logmsg pre, #logmsg blockquote { margin: 0 0 1em 0; }
#logmsg p, #logmsg li, #logmsg dt, #logmsg dd { line-height: 14pt; }
#logmsg h1, #logmsg h2, #logmsg h3, #logmsg h4, #logmsg h5, #logmsg h6 { margin: .5em 0; }
#logmsg h1:first-child, #logmsg h2:first-child, #logmsg h3:first-child, #logmsg h4:first-child, #logmsg h5:first-child, #logmsg h6:first-child { margin-top: 0; }
#logmsg ul, #logmsg ol { padding: 0; list-style-position: inside; margin: 0 0 0 1em; }
#logmsg ul { text-indent: -1em; padding-left: 1em; }#logmsg ol { text-indent: -1.5em; padding-left: 1.5em; }
#logmsg > ul, #logmsg > ol { margin: 0 0 1em 0; }
#logmsg pre { background: #eee; padding: 1em; }
#logmsg blockquote { border: 1px solid #fa0; border-left-width: 10px; padding: 1em 1em 0 1em; background: white;}
#logmsg dl { margin: 0; }
#logmsg dt { font-weight: bold; }
#logmsg dd { margin: 0; padding: 0 0 0.5em 0; }
#logmsg dd:before { content:'\00bb';}
#logmsg table { border-spacing: 0px; border-collapse: collapse; border-top: 4px solid #fa0; border-bottom: 1px solid #fa0; background: #fff; }
#logmsg table th { text-align: left; font-weight: normal; padding: 0.2em 0.5em; border-top: 1px dotted #fa0; }
#logmsg table td { text-align: right; border-top: 1px dotted #fa0; padding: 0.2em 0.5em; }
#logmsg table thead th { text-align: center; border-bottom: 1px solid #fa0; }
#logmsg table th.Corner { text-align: left; }
#logmsg hr { border: none 0; border-top: 2px dashed #fa0; height: 1px; }
#header, #footer { color: #fff; background: #636; border: 1px #300 solid; padding: 6px; }
#patch { width: 100%; }
#patch h4 {font-family: verdana,arial,helvetica,sans-serif;font-size:10pt;padding:8px;background:#369;color:#fff;margin:0;}
#patch .propset h4, #patch .binary h4 {margin:0;}
#patch pre {padding:0;line-height:1.2em;margin:0;}
#patch .diff {width:100%;background:#eee;padding: 0 0 10px 0;overflow:auto;}
#patch .propset .diff, #patch .binary .diff  {padding:10px 0;}
#patch span {display:block;padding:0 10px;}
#patch .modfile, #patch .addfile, #patch .delfile, #patch .propset, #patch .binary, #patch .copfile {border:1px solid #ccc;margin:10px 0;}
#patch ins {background:#dfd;text-decoration:none;display:block;padding:0 10px;}
#patch del {background:#fdd;text-decoration:none;display:block;padding:0 10px;}
#patch .lines, .info {color:#888;background:#fff;}
--></style>
<div id="msg">
<dl class="meta">
<dt>Revision</dt> <dd><a href="https://trac.macports.org/changeset/141843">141843</a></dd>
<dt>Author</dt> <dd>dstrubbe@macports.org</dd>
<dt>Date</dt> <dd>2015-10-29 11:01:49 -0700 (Thu, 29 Oct 2015)</dd>
</dl>

<h3>Log Message</h3>
<pre>berkeleygw:
* Fix cpp issues by disabling use of gcc5, gcc6, clang for C, and modifying configure for llvm-gcc42. (A new version of the code is needed to enable use of these other cpp's.)
* Add cc and cxx to compilers.choose so we use more modern GCC rather than llvm-gcc42 when a GCC variant is selected.
* Comment on why dragonegg is not selected.
* Select appropriate number of MPI tasks for test based on hardware.
* Remove unnecessary specification 'test.cmd make' which is the default.</pre>

<h3>Modified Paths</h3>
<ul>
<li><a href="#trunkdportsscienceberkeleygwPortfile">trunk/dports/science/berkeleygw/Portfile</a></li>
</ul>

</div>
<div id="patch">
<h3>Diff</h3>
<a id="trunkdportsscienceberkeleygwPortfile"></a>
<div class="modfile"><h4>Modified: trunk/dports/science/berkeleygw/Portfile (141842 => 141843)</h4>
<pre class="diff"><span>
<span class="info">--- trunk/dports/science/berkeleygw/Portfile        2015-10-29 17:47:56 UTC (rev 141842)
+++ trunk/dports/science/berkeleygw/Portfile        2015-10-29 18:01:49 UTC (rev 141843)
</span><span class="lines">@@ -27,9 +27,18 @@
</span><span class="cx">                     port:fftw
</span><span class="cx"> # fftw port always has a Fortran variant
</span><span class="cx"> 
</span><ins>+# fine for C and C++, but not for cpp on Fortran here
+compiler.blacklist  *clang*
+
</ins><span class="cx"> # test hangs in Epsilon with OpenMPI, for unknown reason.
</span><del>-compilers.choose    fc cpp
-mpi.setup           require_fortran -dragonegg -openmpi -openmpi_devel
</del><ins>+# no appropriate way to set cpp for gcc5, gcc6, or clang
+# dragonegg fails to link with error
+#   Undefined symbols for architecture x86_64:
+#   &quot;_llvm.objectsize.i64&quot;, referenced from:
+#   _spg_get_international in libsymspg.a(spglib.o)
+#   _spg_get_schoenflies in libsymspg.a(spglib.o)
+compilers.choose    fc cc cxx cpp
+mpi.setup           require_fortran -dragonegg -openmpi -openmpi_devel -gcc5 -gcc6
</ins><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> if {[mpi_variant_isset]} {
</span><span class="cx">     depends_lib-append  port:scalapack
</span><span class="lines">@@ -56,12 +65,16 @@
</span><span class="cx"> destroot.post_args  INSTDIR=${destroot}${prefix}
</span><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> test.run            yes
</span><del>-test.cmd            make
</del><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> pre-test {
</span><span class="cx">     if {[mpi_variant_isset]} {
</span><span class="cx">         test.args           TESTSCRIPT=&quot;MPIEXEC=${prefix}/bin/${mpi.exec} make check-parallel&quot;
</span><span class="cx">         test.target         check-jobscript
</span><ins>+
+        if {![catch {sysctl hw.ncpu} ncpus]} {
+            test.env-append OCT_TEST_NJOBS=$ncpus
+        }
+        ui_msg &quot;Running testsuite in parallel with $ncpus MPI tasks&quot;       
</ins><span class="cx">     } else {
</span><span class="cx">         test.target         check
</span><span class="cx">     }
</span><span class="lines">@@ -71,14 +84,15 @@
</span><span class="cx">     For the purposes of record-keeping and support, please register an account at www.berkeleygw.org.
</span><span class="cx"> }
</span><span class="cx"> 
</span><del>-# more options that could be added: threads, openmpi, mpich
</del><ins>+# more options that could be added: threads, OpenBLAS, Accelerate
</ins><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> pre-build {
</span><span class="cx">     build.args      LINK=&quot;${configure.fc}&quot; CC_COMP=${configure.cxx} C_COMP=${configure.cc} C_LINK=${configure.cxx} \
</span><span class="cx">                     LAPACKLIB=&quot;-L${prefix}/lib/ -lsatlas&quot;
</span><span class="cx"> 
</span><ins>+    # +g95 must be working in conjunction with +llvm
</ins><span class="cx">     if {[variant_isset g95]} {
</span><del>-                    build.args-append COMPFLAG=&quot;-DG95&quot; FCPP=&quot;${configure.cc} -P -E -ansi&quot; \
</del><ins>+                    build.args-append COMPFLAG=&quot;-DG95&quot; FCPP=&quot;${configure.cpp} -P -ansi&quot; \
</ins><span class="cx">                         F90free=&quot;${prefix}/bin/g95 -ffree-form -ffree-line-length-huge -fno-second-underscore&quot; \
</span><span class="cx">                         MOD_OPT=&quot;-fmod=&quot;
</span><span class="cx">         # test, destroot args needed just to avoid trying to build in the test/openmp directory unnecessarily
</span></span></pre>
</div>
</div>

</body>
</html>