<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.1//EN"
"http://www.w3.org/TR/xhtml11/DTD/xhtml11.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head><meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8" />
<title>[152008] trunk/dports/science/seqan-apps/Portfile</title>
</head>
<body>

<style type="text/css"><!--
#msg dl.meta { border: 1px #006 solid; background: #369; padding: 6px; color: #fff; }
#msg dl.meta dt { float: left; width: 6em; font-weight: bold; }
#msg dt:after { content:':';}
#msg dl, #msg dt, #msg ul, #msg li, #header, #footer, #logmsg { font-family: verdana,arial,helvetica,sans-serif; font-size: 10pt;  }
#msg dl a { font-weight: bold}
#msg dl a:link    { color:#fc3; }
#msg dl a:active  { color:#ff0; }
#msg dl a:visited { color:#cc6; }
h3 { font-family: verdana,arial,helvetica,sans-serif; font-size: 10pt; font-weight: bold; }
#msg pre { overflow: auto; background: #ffc; border: 1px #fa0 solid; padding: 6px; }
#logmsg { background: #ffc; border: 1px #fa0 solid; padding: 1em 1em 0 1em; }
#logmsg p, #logmsg pre, #logmsg blockquote { margin: 0 0 1em 0; }
#logmsg p, #logmsg li, #logmsg dt, #logmsg dd { line-height: 14pt; }
#logmsg h1, #logmsg h2, #logmsg h3, #logmsg h4, #logmsg h5, #logmsg h6 { margin: .5em 0; }
#logmsg h1:first-child, #logmsg h2:first-child, #logmsg h3:first-child, #logmsg h4:first-child, #logmsg h5:first-child, #logmsg h6:first-child { margin-top: 0; }
#logmsg ul, #logmsg ol { padding: 0; list-style-position: inside; margin: 0 0 0 1em; }
#logmsg ul { text-indent: -1em; padding-left: 1em; }#logmsg ol { text-indent: -1.5em; padding-left: 1.5em; }
#logmsg > ul, #logmsg > ol { margin: 0 0 1em 0; }
#logmsg pre { background: #eee; padding: 1em; }
#logmsg blockquote { border: 1px solid #fa0; border-left-width: 10px; padding: 1em 1em 0 1em; background: white;}
#logmsg dl { margin: 0; }
#logmsg dt { font-weight: bold; }
#logmsg dd { margin: 0; padding: 0 0 0.5em 0; }
#logmsg dd:before { content:'\00bb';}
#logmsg table { border-spacing: 0px; border-collapse: collapse; border-top: 4px solid #fa0; border-bottom: 1px solid #fa0; background: #fff; }
#logmsg table th { text-align: left; font-weight: normal; padding: 0.2em 0.5em; border-top: 1px dotted #fa0; }
#logmsg table td { text-align: right; border-top: 1px dotted #fa0; padding: 0.2em 0.5em; }
#logmsg table thead th { text-align: center; border-bottom: 1px solid #fa0; }
#logmsg table th.Corner { text-align: left; }
#logmsg hr { border: none 0; border-top: 2px dashed #fa0; height: 1px; }
#header, #footer { color: #fff; background: #636; border: 1px #300 solid; padding: 6px; }
#patch { width: 100%; }
#patch h4 {font-family: verdana,arial,helvetica,sans-serif;font-size:10pt;padding:8px;background:#369;color:#fff;margin:0;}
#patch .propset h4, #patch .binary h4 {margin:0;}
#patch pre {padding:0;line-height:1.2em;margin:0;}
#patch .diff {width:100%;background:#eee;padding: 0 0 10px 0;overflow:auto;}
#patch .propset .diff, #patch .binary .diff  {padding:10px 0;}
#patch span {display:block;padding:0 10px;}
#patch .modfile, #patch .addfile, #patch .delfile, #patch .propset, #patch .binary, #patch .copfile {border:1px solid #ccc;margin:10px 0;}
#patch ins {background:#dfd;text-decoration:none;display:block;padding:0 10px;}
#patch del {background:#fdd;text-decoration:none;display:block;padding:0 10px;}
#patch .lines, .info {color:#888;background:#fff;}
--></style>
<div id="msg">
<dl class="meta">
<dt>Revision</dt> <dd><a href="https://trac.macports.org/changeset/152008">152008</a></dd>
<dt>Author</dt> <dd>mf2k@macports.org</dd>
<dt>Date</dt> <dd>2016-08-26 12:55:04 -0700 (Fri, 26 Aug 2016)</dd>
</dl>

<h3>Log Message</h3>
<pre>seqan-apps: Update to version 2.1.1. (#51349)</pre>

<h3>Modified Paths</h3>
<ul>
<li><a href="#trunkdportsscienceseqanappsPortfile">trunk/dports/science/seqan-apps/Portfile</a></li>
</ul>

</div>
<div id="patch">
<h3>Diff</h3>
<a id="trunkdportsscienceseqanappsPortfile"></a>
<div class="modfile"><h4>Modified: trunk/dports/science/seqan-apps/Portfile (152007 => 152008)</h4>
<pre class="diff"><span>
<span class="info">--- trunk/dports/science/seqan-apps/Portfile        2016-08-26 18:10:21 UTC (rev 152007)
+++ trunk/dports/science/seqan-apps/Portfile        2016-08-26 19:55:04 UTC (rev 152008)
</span><span class="lines">@@ -5,13 +5,13 @@
</span><span class="cx"> PortGroup           cmake 1.0
</span><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> name                seqan-apps
</span><del>-version             1.4.1
</del><ins>+version             2.1.1
</ins><span class="cx"> categories          science
</span><span class="cx"> platforms           darwin
</span><span class="cx"> universal_variant   no
</span><span class="cx"> 
</span><del>-license             LGPL-3
-maintainers         fu-berlin.de:david.weese
</del><ins>+license             BSD LGPL-3 GPL-3
+maintainers         fu-berlin.de:rene.rahn
</ins><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> description         Applications distributed with the SeqAn library
</span><span class="cx"> 
</span><span class="lines">@@ -24,17 +24,18 @@
</span><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> master_sites        http://packages.seqan.de/seqan-src
</span><span class="cx"> distfiles           seqan-src-${version}${extract.suffix}
</span><del>-distname            seqan-${version}
-checksums           rmd160  0a9b9e8f669b719f8e72741562c9fed096320987 \
-                    sha256  47c4cf698d9879000b7de514a5cb425c18c26c8b8a81e469da23b757f7680a8e
</del><ins>+distname            seqan-seqan-v${version}
</ins><span class="cx"> 
</span><del>-# FIXME: llvm-gcc42 is broken, https://trac.macports.org/ticket/40713
-# FIXME: SeqAn 1.4.1 does not yet compile with gcc49 (will be fixed in the upcoming release 1.5)
-# For OpenMP only clang really needs to be blacklisted
</del><ins>+checksums           rmd160  30996a718192e49f62843d0fe09cffdf96c92342 \
+                    sha256  df083d5939d7e73fd00bbc6bb291ac7ea7b8d446cf89a9758fdffdc0eca9ec1c
</ins><span class="cx"> 
</span><del>-compiler.blacklist  *gcc-4.2 *clang* macports-gcc-4.9
-compiler.fallback   macports-gcc-4.8 macports-gcc-4.7 macports-gcc-4.6 macports-gcc-4.5 macports-gcc-4.3
</del><ins>+# llvm-gcc42 is broken and won't be fixed anymore, see: https://trac.macports.org/ticket/40713
+# For OpenMP only the apple clang version really needs to be blacklisted.
+# Macports clang-3.8 and higher fully support OpenMP 3.1, so we make them the default fallback option and remove gcc from this list.
</ins><span class="cx"> 
</span><ins>+compiler.blacklist  *gcc* *clang-3.7 *clang-3.6 *clang-3.5 *clang-3.4 *clang-3.3 *dragonegg*
+compiler.fallback   macports-clang-3.9 macports-clang-3.8
+
</ins><span class="cx"> configure.args-append   -DSEQAN_BUILD_SYSTEM=SEQAN_RELEASE_APPS
</span><span class="cx"> 
</span><span class="cx"> livecheck.url       http://packages.seqan.de/
</span></span></pre>
</div>
</div>

</body>
</html>