<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">9# cat .bash_aliases<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##~/bash_aliases<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##USER_SPECIFIC_ALIASES<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##Environmental_Variables<br>######################################################################<br>username=`id -nu`<br>useruid=`id -u`<br>export TMPDIR=/Users/$username/.emacs.d/tmp<br>######################################################################<br>##Specific_to_each_user_UUID<br>alias emacsclient="emacsclient --socket-name=$TMPDIR/emacs$useruid/server"<br>######################################################################<br><br><br>10# cat .bash_logout<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##~/.bash_logout:executed by bash(1) when login shell exits<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##When_leaving_the_console_clear_the_screen_to_increase_privacy<br>if [ "$SHLVL" = 1 ]; then<br> [ -x /opt/local/bin/clear ] && /opt/local/bin/clear -q<br>fi<br>######################################################################<br><br>11# cat .bash_profile<br>######################################################################<br>##~/.bash_profile<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##System-wide_.bashrc_file_for_interactive_bash(1)_shells<br>if [ -z "$PS1" ]; then<br> return<br>fi<br>######################################################################<br>if [ -f /opt/local/etc/profile.d/bash_completion.sh ]; then<br>. /opt/local/etc/profile.d/bash_completion.sh<br>fi<br>######################################################################<br>shopt -s checkwinsize<br>######################################################################<br>PROMPT_HOSTNAME='Aramayolab00'<br>#PROMPT_COLOR='0;34m'<br>PROMPT_COLOR='1;32m'<br>######################################################################<br>##If_I_am_root_set_the_prompt_to_bright_red<br>if [ ${LOGNAME} == root ];<br>then<br> PROMPT_COLOR='1;31m'<br>fi<br>######################################################################<br>PS1='\[\e]1;${PROMPT_HOSTNAME}\a\<br>\e[${PROMPT_COLOR}\]\<br>[\t][\u][${PWD}]\n\#\$ \<br>\[\e[m\]'<br>######################################################################<br>source ~/.bashrc<br>######################################################################<br><br>12# cat .bashrc<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##~/.bashrc<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##TO_MACPORTS (/opt/local):SERVER_AND_CLIENT<br>export PATH=/opt/local/bin:/opt/local/sbin:$PATH<br>export PATH=/opt/local/lib:$PATH<br>export PATH=/opt/local/libexec/gnubin:$PATH<br>export MANPATH=/opt/local/share/man:$MANPATH<br>######################################################################<br>source ~/.bash_aliases<br>######################################################################<br>source /usr/local/bashrc<br>######################################################################<br>source /usr/local/bash_aliases<br>######################################################################<br><br>13# cat /usr/local/bashrc<br>export PATH=/usr/local/bioinfosoft/samtools-1.1:$PATH<br>export PATH=/usr/local/bioinfosoft/samtools-1.1/htslib-1.1:$PATH<br>export PATH=/usr/local/bioinfosoft/IGVTools:$PATH<br><br>14# cat /usr/local/bash_aliases<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##/usr/local/bash_aliases<br>##version_Fri Aug 9 15:44:30 CDT 2013<br>######################################################################<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##Environmental_Variables<br>######################################################################<br>export EDITOR=emacs<br>export ALTERNATE_EDITOR=emacsclient<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##ALIASES<br>######################################################################<br>#alias ls="ls -alFG"<br>alias cccrsync="rsync -v -A -z -u -N -E -X -H -l -go --numeric-ids -D -rtpx --fileflags --force-change --protect-args --delete-during"<br>alias ccl="clean&&clear&&ls"<br>alias cl="clear"<br>alias clean="rm -f *~;rm -f .*~"<br>alias cln="rm -f *~;rm -f .*~"<br>alias dd="du -sh"<br>alias dds="du -hd"<br>alias ddspace="df -hl"<br>alias dir="dir --color=auto"<br>alias ee="exit"<br><br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature">--Rodolfo<br></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 11:31 AM, Brandon Allbery <span dir="ltr"><<a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">The next question is what is in that .bashrc. (The state of the directory you created isn't relevant, since things already went sideways when the port looked for it in the first place.)</div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 12:18 PM, Rodolfo Aramayo <span dir="ltr"><<a href="mailto:raramayo@gmail.com" target="_blank">raramayo@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">Yes at /var/root<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">The directory I created was clean, no hidden files...<span><font color="#888888"><br></font></span></div></div><div class="gmail_extra"><span><font color="#888888"><br clear="all"><div><div>--Rodolfo<br></div></div></font></span><div><div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 11:01 AM, Brandon Allbery <span dir="ltr"><<a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><span><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 11:53 AM, Rodolfo Aramayo <span dir="ltr"><<a href="mailto:raramayo@gmail.com" target="_blank">raramayo@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">mig -header kcmrpc.h -user kcmrpc.c -sheader /dev/null \<br> -server /dev/null -I. ./kcmrpc.defs<br>mktemp: mkdtemp failed on /Users/root/.emacs.d/tmp/mig.rxV7yX: No such file or directory<br>mktemp: mkdtemp failed on /Users/root/.emacs.d/tmp/mig.pgFbT4: No such file or directory<br></div></blockquote></div><br></span>errr...</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><div>Does root have a .bashrc?</div><span><font color="#888888"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div>brandon s allbery kf8nh sine nomine associates</div><div><a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a> <a href="mailto:ballbery@sinenomine.net" target="_blank">ballbery@sinenomine.net</a></div><div>unix, openafs, kerberos, infrastructure, xmonad <a href="http://sinenomine.net" target="_blank">http://sinenomine.net</a></div></div></div>
</font></span></div></div>
</blockquote></div><br></div></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div>brandon s allbery kf8nh sine nomine associates</div><div><a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a> <a href="mailto:ballbery@sinenomine.net" target="_blank">ballbery@sinenomine.net</a></div><div>unix, openafs, kerberos, infrastructure, xmonad <a href="http://sinenomine.net" target="_blank">http://sinenomine.net</a></div></div></div>
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