<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">9# cat .bash_aliases<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##~/bash_aliases<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##USER_SPECIFIC_ALIASES<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##Environmental_Variables<br>######################################################################<br>username=`id -nu`<br>useruid=`id -u`<br>export TMPDIR=/Users/$username/.emacs.d/tmp<br>######################################################################<br>##Specific_to_each_user_UUID<br>alias emacsclient=&quot;emacsclient --socket-name=$TMPDIR/emacs$useruid/server&quot;<br>######################################################################<br><br><br>10# cat .bash_logout<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##~/.bash_logout:executed by bash(1) when login shell exits<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##When_leaving_the_console_clear_the_screen_to_increase_privacy<br>if [ &quot;$SHLVL&quot; = 1 ]; then<br>    [ -x /opt/local/bin/clear ] &amp;&amp; /opt/local/bin/clear -q<br>fi<br>######################################################################<br><br>11# cat .bash_profile<br>######################################################################<br>##~/.bash_profile<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##System-wide_.bashrc_file_for_interactive_bash(1)_shells<br>if [ -z &quot;$PS1&quot; ]; then<br>   return<br>fi<br>######################################################################<br>if [ -f /opt/local/etc/profile.d/bash_completion.sh ]; then<br>. /opt/local/etc/profile.d/bash_completion.sh<br>fi<br>######################################################################<br>shopt -s checkwinsize<br>######################################################################<br>PROMPT_HOSTNAME=&#39;Aramayolab00&#39;<br>#PROMPT_COLOR=&#39;0;34m&#39;<br>PROMPT_COLOR=&#39;1;32m&#39;<br>######################################################################<br>##If_I_am_root_set_the_prompt_to_bright_red<br>if [ ${LOGNAME} == root ];<br>then<br>    PROMPT_COLOR=&#39;1;31m&#39;<br>fi<br>######################################################################<br>PS1=&#39;\[\e]1;${PROMPT_HOSTNAME}\a\<br>\e[${PROMPT_COLOR}\]\<br>[\t][\u][${PWD}]\n\#\$ \<br>\[\e[m\]&#39;<br>######################################################################<br>source ~/.bashrc<br>######################################################################<br><br>12# cat .bashrc<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##~/.bashrc<br>##version_2012_03_29<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##TO_MACPORTS (/opt/local):SERVER_AND_CLIENT<br>export PATH=/opt/local/bin:/opt/local/sbin:$PATH<br>export PATH=/opt/local/lib:$PATH<br>export PATH=/opt/local/libexec/gnubin:$PATH<br>export MANPATH=/opt/local/share/man:$MANPATH<br>######################################################################<br>source ~/.bash_aliases<br>######################################################################<br>source /usr/local/bashrc<br>######################################################################<br>source /usr/local/bash_aliases<br>######################################################################<br><br>13# cat /usr/local/bashrc<br>export PATH=/usr/local/bioinfosoft/samtools-1.1:$PATH<br>export PATH=/usr/local/bioinfosoft/samtools-1.1/htslib-1.1:$PATH<br>export PATH=/usr/local/bioinfosoft/IGVTools:$PATH<br><br>14# cat /usr/local/bash_aliases<br>######################################################################<br>######################################################################<br>##/usr/local/bash_aliases<br>##version_Fri Aug  9 15:44:30 CDT 2013<br>######################################################################<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##Environmental_Variables<br>######################################################################<br>export EDITOR=emacs<br>export ALTERNATE_EDITOR=emacsclient<br>######################################################################<br><br>######################################################################<br>##ALIASES<br>######################################################################<br>#alias ls=&quot;ls -alFG&quot;<br>alias cccrsync=&quot;rsync -v -A -z -u -N -E -X -H -l -go --numeric-ids -D -rtpx --fileflags --force-change --protect-args --delete-during&quot;<br>alias ccl=&quot;clean&amp;&amp;clear&amp;&amp;ls&quot;<br>alias cl=&quot;clear&quot;<br>alias clean=&quot;rm -f *~;rm -f .*~&quot;<br>alias cln=&quot;rm -f *~;rm -f .*~&quot;<br>alias dd=&quot;du -sh&quot;<br>alias dds=&quot;du -hd&quot;<br>alias ddspace=&quot;df -hl&quot;<br>alias dir=&quot;dir --color=auto&quot;<br>alias ee=&quot;exit&quot;<br><br></div></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature">--Rodolfo<br></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 11:31 AM, Brandon Allbery <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">The next question is what is in that .bashrc. (The state of the directory you created isn&#39;t relevant, since things already went sideways when the port looked for it in the first place.)</div><div class="HOEnZb"><div class="h5"><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 12:18 PM, Rodolfo Aramayo <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:raramayo@gmail.com" target="_blank">raramayo@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">Yes at /var/root<br></div><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">The directory I created was clean, no hidden files...<span><font color="#888888"><br></font></span></div></div><div class="gmail_extra"><span><font color="#888888"><br clear="all"><div><div>--Rodolfo<br></div></div></font></span><div><div>
<br><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 11:01 AM, Brandon Allbery <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><span><div class="gmail_quote">On Wed, Aug 26, 2015 at 11:53 AM, Rodolfo Aramayo <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:raramayo@gmail.com" target="_blank">raramayo@gmail.com</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div class="gmail_default" style="font-family:courier new,monospace">mig -header kcmrpc.h -user kcmrpc.c -sheader /dev/null \<br>        -server /dev/null -I. ./kcmrpc.defs<br>mktemp: mkdtemp failed on /Users/root/.emacs.d/tmp/mig.rxV7yX: No such file or directory<br>mktemp: mkdtemp failed on /Users/root/.emacs.d/tmp/mig.pgFbT4: No such file or directory<br></div></blockquote></div><br></span>errr...</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><div>Does root have a .bashrc?</div><span><font color="#888888"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div>brandon s allbery kf8nh                               sine nomine associates</div><div><a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a>                                  <a href="mailto:ballbery@sinenomine.net" target="_blank">ballbery@sinenomine.net</a></div><div>unix, openafs, kerberos, infrastructure, xmonad        <a href="http://sinenomine.net" target="_blank">http://sinenomine.net</a></div></div></div>
</font></span></div></div>
</blockquote></div><br></div></div></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div><div dir="ltr"><div>brandon s allbery kf8nh                               sine nomine associates</div><div><a href="mailto:allbery.b@gmail.com" target="_blank">allbery.b@gmail.com</a>                                  <a href="mailto:ballbery@sinenomine.net" target="_blank">ballbery@sinenomine.net</a></div><div>unix, openafs, kerberos, infrastructure, xmonad        <a href="http://sinenomine.net" target="_blank">http://sinenomine.net</a></div></div></div>
</div>
</div></div></blockquote></div><br></div>